Struktura organizacyjna
Urzędem kieruje Naczelnik Urzędu.
Strukturę urzędu skarbowego tworzą komórki organizacyjne funkcjonujące w ramach pionów organizacyjnych.
Strukturę Drugiego Urzędu Skarbowego w Białymstoku przedstawia schemat organizacyjny.
Zakres zadań poszczególnych komórek organizacyjnych określa regulamin organizacyjny urzędu.