Pan Marcin Rogowski rozpoczął pracę w sądownictwie 1 listopada 1998 r., obejmując stanowisko asesora sądowego. Następnie, 28 listopada 2000 r., na mocy postanowienia Prezydenta Rzeczypospolitej Polskiej, został mianowany sędzią Sądu Rejonowego w Stalowej Woli. Od 1 sierpnia 2004 r. do 19 kwietnia 2005 r. pełnił funkcję wiceprezesa Sądu Rejonowego w Stalowej Woli, a od 20 kwietnia 2005 r. przez dwie kadencje sprawował funkcję prezesa tego sądu.

Na podstawie postanowienia Prezydenta Rzeczypospolitej Polskiej z dnia 28 września 2016 r. został powołany na stanowisko sędziego Sądu Okręgowego w Tarnobrzegu. Od 1 stycznia 2017 r. do 19 sierpnia 2019 r. pełnił funkcję wizytatora ds. komorniczych w Sądzie Okręgowym w Tarnobrzegu. 2 stycznia 2019 r. został powołany na stanowisko wiceprezesa tego sądu.

Jest przewodniczącym I Wydziału Cywilnego Sądu Okręgowego w Tarnobrzegu.