Sekwencjonowanie genomu SARS-CoV-2 w laboratorium WSSE w Łodzi
Laboratorium medyczne Wojewódzkiej Stacji Sanitarno-Epidemiologicznej w Łodzi z dniem 30 czerwca 2021 r. wdrożyło technologię nanoporowego sekwencjonowania genomu koronawirusa SARS-CoV-2 i rozpoczęło proces sekwencjonowania próbek od pacjentów, którzy uzyskali wynik pozytywny w badaniu molekularnym PCR.
Sekwencjonowanie genomu to odczytywanie sekwencji par nukleotydów w cząsteczce RNA koronawirusa – inaczej odczytywanie informacji genetycznej, pozwalające na monitorowanie zmienności materiału genetycznego (wykrywanie mutacji).
Sekwencjonowanie ma na celu ocenę częstotliwości występowania nowych wariantów koronawirusa o większej zaraźliwości i zjadliwości, również przełamujących odporność poszczepienną oraz charakterystykę szczepów wirusa SARS-CoV-2, odpowiedzialnych za reinfekcję oraz zakażenia osób zaszczepionych.
Proces przebiega w dwóch etapach:
- przygotowanie próbki do sekwencjonowania, tzw. tworzenie biblioteki;
- automatyczne sekwencjonowanie w urządzeniu sekwencjonującym, tzw. sekwenatorze.
Przepustowość laboratorium – 480 próbek/tydzień.