Apteki zakładowe odpowiadają za zaopatrzenie:

• podmiotów leczniczych wykonujących działalność leczniczą – głównie gabinetów, pracowni, izb chorych i oddziałów terapeutycznych,
• innych zakładów leczniczych podmiotów leczniczych wykonujących stacjonarne i całodobowe świadczenia zdrowotne, które zostały utworzone przez:
  • ministra obrony narodowej – wojskowe zakłady opieki zdrowotnej i inne jednostki organizacyjne wojskowej służby zdrowia,
  • ministra sprawiedliwości – areszty śledcze oraz zakłady karne.

Apteki zakładowe powinny znajdować się na terenie zakładu opieki zdrowotnej, aby zapewniać prawidłowe zaopatrzenie oddziałów w leki i wyroby medyczne.