Genomowa Mapa Polski w otwartym dostępie – digitalizacja zasobów biomolekularnych pracowni BIOBANK UŁ
Uniwersytet Łódzki digitalizuje genetyczne zasoby pracowni Biobank. Udostępnianie tych zbiorów odbywać się będzie z wykorzystaniem lokalnej instancji Europejskiego Archiwum Genomów (Local EGA). Lokalna (polska) instancja EGA jako pierwsza w kraju powstanie na Uniwersytecie Łódzkim.
Pracownia BIOBANK
Pracownia Biobank jest jednostką naukową należącą do Uniwersytetu Łódzkiego. Zajmuje się zagadnieniami biologii molekularnej i genetyki oraz pobieraniem, gromadzeniem, przechowywaniem i udostępnianiem materiału biologicznego.
Wygenerowane w trakcie projektu dane (pełne genomy i egzomy) stworzą interesujący dla badaczy zbiór informacji o szerokich zastosowaniach w nauce w szczególności w rozwoju medycyny spersonalizowanej. Pracownia jest w posiadaniu głównie materiałów ze śliny i krwi, ale również zaplecza technicznego do biobankowania surowicy, osocza i komórek jednojądrzastych.
Cel projektu
Głównym celem projektu jest digitalizacja genetycznych zasobów pracowni Biobank oraz udostępnienie ich z wykorzystaniem repozytorium Local EGA. Local EGA – lokalna (Polska) instancja Europejskiego Archiwum Genomów jako pierwsza w kraju powstanie na Uniwersytecie Łódzkim. Wytworzona zostanie infrastruktura służąca do bezpłatnego udostępniania zdigitalizowanych zasobów Biobank, dotyczących genetyki człowieka.
Zbiory BIOBANK
Digitalizacji poddany zostanie fragment kolekcji POPULOUS - zbiór materiału biologicznego pobranego od mieszkańców Polski, odwzorowującego strukturę demograficzną kraju.
Produktem końcowym projektu mają być zdigitalizowane genomy i pełne egzony Polaków, które pochodzą dokładnie od 750 anonimowych dawców, którzy wybrani zostali spośród grupy ponad 10 000 ochotników. Zbiory przetworzone zostaną za pomocą utworzenia centrum digitalizacji danych genetycznych człowieka. Upowszechnione w ten sposób informacje dostarczą cennej wiedzy na temat genomiki populacji polskiej, zamykając lukę wiedzy w tym obszarze.
Międzynarodowy potencjał
Wykorzystanie repozytorium Local EGA oznacza włączenie zdeponowanych w nim danych do Europejskiego ekosystemu naukowo-badawczego (nadzorowanego przez Europejski Instytut Bioinformatyki, Center for Genomic Regulation i konsorcjum Elixir). Dzięki realizacji tego przedsięwzięcia droga do udziału w międzynarodowych projektach zostanie otwarta.
W repozytorium dane będą mogły zdeponować wszystkie zainteresowane osoby, nie tylko te powiązane z Uniwersytetem Łódzkim.
Dane projektu
Nazwa projektu: Genomowa mapa Polski w otwartym dostępie - digitalizacja zasobów biomolekularnych pracowni Biobank UŁ
Beneficjent: UNIWERSYTET ŁÓDZKI
Finansowanie
Program: Program Operacyjny Polska Cyfrowa
Działanie: 2.3. Cyfrowa dostępność i użyteczność informacji sektora publicznego, poddziałanie: 2.3.1. Cyfrowe udostępnienie informacji sektora publicznego ze źródeł administracyjnych i zasobów nauki
Wartość projektu: 13 500 000,00 PLN
Wydatki kwalifikowalne: 13 500 000,00 PLN
Wartość unijnego dofinansowania: 11 425 050,00 PLN