W sprawie konkursu „Szybka Ścieżka – innowacje cyfrowe”, po pierwszych sygnałach o możliwych nieprawidłowościach w NCBR, w Ministerstwie Funduszy i Polityki Regionalnej zostały podjęte niezwłoczne decyzje  o przeprowadzeniu kontroli w NCBR. Wnioski z kontroli są w znacznej mierze zbieżne z wnioskami Najwyższej Izby Kontroli. Działania MFiPR w NCBR były przeprowadzone za wiedzą Komisji Europejskiej.

Konkursy na dyrektora Narodowego Centrum Badań i Rozwoju odbyły się zgodnie z obowiązującymi przepisami prawa. Do czasu formalnego powołania dyrektora – zgodnie z ustawą o NCBR – kierowała osoba pełniąca obowiązki dyrektora.