Wydziały
Wydział Ochrony Przyrody i Obszarów Natura 2000 (WPN)
Realizuje zadania z zakresu ochrony gatunkowej, siedlisk przyrodniczych i obszarów chronionych, ochrony zadrzewień, terenów zielonych oraz wdrażania polityki ekologicznej państwa w tym zakresie. Opracowuje plany ochrony i plany zadań ochronnych dla rezerwatów przyrody oraz plany ochrony i plany zadań ochronnych dla obszarów Natura 2000. Szacuje szkody wyrządzane przez zwierzęta objęte ochroną, za które odpowiada Skarb Państwa. Uzgadnia również dokumenty planistyczne z zakresu zagospodarowania przestrzennego.
Wydział Ocen Oddziaływania na Środowisko (WOOŚ)
Prowadzi postępowania w sprawie wydania decyzji o środowiskowych uwarunkowaniach. Wydaje opinie i uzgodnienia w toku postępowań w sprawie wydania decyzji o środowiskowych uwarunkowaniach, prowadzonych przez inne organy. Wydaje opinie i uzgodnienia w toku prowadzenia strategicznych ocen oddziaływania na środowisko. Współdziała z Regionalną Komisją Ocen Oddziaływania na Środowisko.
Wydział Zapobiegania i Naprawy Szkód w Środowisku oraz Informacji o Środowisku i Zarządzania Środowiskiem (WSI)
Wydział realizuje zadania w zakresie zapobiegania i naprawy szkód w środowisku, historycznych zanieczyszczeń powierzchni ziemi oraz ustalania warunków korzystania ze środowiska na terenach zamkniętych. Do zadań wydziału należy także zarządzanie systemem informacji publicznej, obsługa Biuletynu Informacji Publicznej oraz udostępnianie informacji o środowisku i jego ochronie.
Wydziały Spraw Terenowych (WST)
Opracowują plany ochrony i plany zadań ochronnych dla rezerwatów przyrody oraz plany ochrony i plany zadań ochronnych dla obszarów Natura 2000. Szacują szkody wyrządzane przez zwierzęta objęte ochroną, za które odpowiada Skarb Państwa. Uzgadniają dokumenty planistyczne z zakresu zagospodarowania przestrzennego. Wydają opinie i uzgodnienia w toku postępowań w sprawie wydania decyzji o środowiskowych uwarunkowaniach, prowadzonych przez inne organy. Wydają opinie i uzgodnienia w toku prowadzenia strategicznych ocen oddziaływania na środowisko.
Wydział Organizacyjno - Administracyjny (WOA)
Realizuje zadania w zakresie obsługi kadrowej i organizacyjnej Regionalnej Dyrekcji Ochrony Środowiska w Lublinie.
Wydział Budżetu i Finansów (WBF)
Do kompetencji Wydziału należy obsługa finansowa urzędu.