Rozebrana zostanie wewnętrzna antresola dworca, wykonany będzie nowy układ funkcjonalno-użytkowy obiektu, na nowo zostanie zagospodarowany teren przed dworcem. Dzięki modernizacji bryła dworca odzyska swój pierwotny kształt. Przywrócony zostanie także historyczny charakter poczekalni – będzie ona bardziej przestronna i zapewni lepszą obsługę podróżnych.

Budynek będzie dostosowany do potrzeb osób z ograniczoną mobilności. Dla osób niewidomych i niedowidzących zaprojektowano system oznaczeń dotykowych i pasów prowadzących. Prace będą prowadzone pod nadzorem konserwatora zabytków. Na czas przebudowy w Białymstoku powstanie dworzec tymczasowy.

Dworzec w Białymstoku jest jednym z prawie 200 dworców objętych największym w historii Polski Programem Inwestycji Dworcowych na lata 2016–2023.