Dzięki diagnozie obecnego stanu użytkowania, uwarunkowań rozwoju i wzajemnych relacji woda-ląd, plan przyznaje priorytety wybranym sposobom użytkowania. Służy temu przyznanie akwenom podstawowych funkcji wiodących, których nie mogą zakłócać inne sposoby ich wykorzystania. Dla każdego z wyznaczonych akwenów sporządzona zostanie karta akwenu, w której zawarte będą szczegółowe rozstrzygnięcia.

Przyjęcie planu zapewni rozwój obszaru morskich wód wewnętrznych w granicach portu morskiego w Szczecinie, bezpieczeństwo żeglugi morskiej, zrównoważony rozwój turystyki nadmorskiej i morskiej oraz polepszenie lub zachowanie istniejącego stanu środowiska.