Nabór wniosków ma charakter konkursowy, a ich ocena odbywa się na podstawie kryteriów podanych do publicznej wiadomości jako załącznik do Regulaminu konkursu (https://www.gov.pl/web/nfosigw/ogloszenie-o-konkursie). Planowana alokacja środków w naborze to 250 mln zł. W toku oceny wniosków, zgodnie z art. 411 ust. 2 ustawy z dnia 27 kwietnia 2001 r. Prawo ochrony środowiska (Dz. U. z 2022 r., poz. 2556) wymagane jest zasięgnięcie opinii ministra właściwego do spraw środowiska.

Termin na składanie wniosków w II naborze programu upłynął 3 października 2022 r. Do NFOŚiGW wpłynęły 52 wnioski, które następnie zostały poddane ocenie formalnej. Po ich przeanalizowaniu, 43 przeszły pozytywnie ocenę formalną NFOŚiGW, w oparciu o kryteria dostępu oraz ocenę merytoryczną, dokonaną zgodnie z kryteriami jakościowymi dopuszczającymi programu I-III. Wszystkie pozytywnie ocenione wnioski zostały przekazane do Ministerstwa Klimatu i Środowiska w celu zaopiniowania i oceny według kryterium jakościowego dopuszczającego IV i zostaną rozpatrzone zgodnie z §3 ust. 4 pkt 8 Regulaminu konkursu - w ciągu 120 dni od daty przesłania przez NFOŚiGW do zaopiniowania przez ministra ostatniego wniosku złożonego w naborze tj. od 9 sierpnia 2023 r.